Ústav
Ústav informatiky a chemie (143)
ID
2027-143-8
Vedoucí
Milan Voršilák
Konzultant
Ctibor Škuta
Aktuální studijní programy
B107-Bioinformatika a chemická informatika
Podstata a cíl práce
Luciferázy jsou jedním z nástrojů užívaných při testování s vysokou propustností. Jejich výhodou je nízké pozadí při měření. Naopak nevýhodou je jejich ovlivnitelnost chemickými látkami. V současné době je k dispozici velké množství dat z pokusů s jejich využitím a je možné analyzovat látky, které s nimi interagují. Tyto látky způsobují falešně pozitivitivní nebo negativní výsledky a bylo by vhodné se jim v tomto typu experimentů vyhnout.
Náplň činnosti studenta
Student ve veřejných databázích (ChEMBL, ECBD) vyhledá vhodná vstupní data. Jejich rozborem identifikuje problematické látky, které mohou zhášet nebo zesilovat signál luciferáz. Vhodnou analýzou těchto látek získá obecné informace, jaké vlastnosti mohou způsobovat problematické chování.